Le système de santé aux Comores est structuré mais gravement sous-financé, confronté à des défis importants caractéristiques des pays en développement. Géré par le Ministère de la Santé, il fonctionne selon un système à plusieurs niveaux, allant des centres de santé locaux aux hôpitaux régionaux et nationaux. Cependant, de nombreux établissements manquent d'électricité fiable, d'eau courante, d'équipements modernes et de fournitures médicales de base. L'instabilité politique a historiquement entravé le développement de politiques et d'infrastructures de santé solides. Pour les expatriés, cela signifie que les soins de santé locaux, tant publics que privés, sont généralement basiques et peuvent ne pas répondre aux normes internationales. Les problèmes médicaux graves ou les procédures complexes nécessitent presque toujours une évacuation médicale vers des établissements mieux équipés dans les pays voisins. Le paiement anticipé des services est une attente courante.

Le système de santé public des Comores est le principal prestataire pour la majorité de la population. Il est organisé depuis les centres de santé au niveau des villages jusqu'aux hôpitaux régionaux et nationaux, l'Hôpital National El-Maarouf à Moroni étant l'établissement principal. Bien que les Comoriens puissent consulter un médecin généraliste gratuitement dans le secteur public, rien n'est gratuit en ce qui concerne les médicaments ou la chirurgie. Les établissements publics sont souvent sous-approvisionnés, en sous-effectif et en mauvais état, manquant d'équipements modernes. Pour les étrangers, l'accès direct au système public pour les soins de routine peut être possible, mais un paiement anticipé est généralement requis. Il n'existe pas de système national formel d'assurance maladie, bien que le gouvernement prévoie d'introduire un régime d'assurance maladie généralisé d'ici 2030. Les temps d'attente peuvent être importants en raison des limitations de ressources. La qualité des soins est basique et les services spécialisés sont extrêmement limités.

Les options de soins de santé privés aux Comores sont très limitées, principalement concentrées à Moroni. Parmi les établissements privés notables figurent l'Hôpital International, l'Hôpital Caritas, le Centre Médical Bahani, le Centre Médical Vouvouni et le Centre Médical Ongoni, tous situés à Moroni. Bien que ces cliniques privées puissent offrir des temps d'attente légèrement plus courts et une attention plus personnalisée, elles sont toujours contraintes par les mêmes limitations de ressources que le système public et peuvent ne pas offrir des soins comparables aux normes occidentales. Elles fournissent généralement des consultations générales, des diagnostics de base et certains services spécialisés comme la cardiologie ou la gynécologie. Les expatriés préfèrent souvent les cliniques privées pour les soins de routine. Les coûts de consultation typiques pour une visite chez un médecin généraliste dans un cadre privé peuvent être d'environ 10 € (environ 11 USD). Pour des procédures plus complexes, les coûts peuvent augmenter considérablement, par exemple, une appendicectomie coûte au moins 200 € (environ 215 USD) et une césarienne jusqu'à 600 € (environ 645 USD).

Les étrangers et les expatriés aux Comores sont confrontés à un paysage de soins de santé qui nécessite une planification minutieuse. Il n'y a pas d'accords de santé réciproques, et un régime national formel d'assurance maladie pour les résidents n'est pas encore en place, bien qu'un soit prévu d'ici 2030. Par conséquent, tous les prestataires de soins, qu'ils soient publics ou privés, exigent généralement un paiement anticipé en Francs Comoriens (KMF) ou en Dollars Américains (USD) avant le traitement. Pour toute maladie ou blessure grave, une assurance évacuation médicale est considérée comme essentielle, car les installations locales sont souvent inadéquates pour les affections complexes. Les expatriés doivent emporter tous les médicaments sur ordonnance nécessaires, ainsi que l'ordonnance de leur médecin, car les stocks des pharmacies sont limités, surtout en dehors de Moroni. Il est également conseillé d'avoir un résumé médical disponible en français.

Compte tenu des limites du système de santé local, la souscription d'une assurance maladie complète est primordiale pour les expatriés aux Comores. Il n'y a actuellement pas de contribution obligatoire à l'assurance maladie publique pour les expatriés, car un régime national généralisé d'assurance maladie est encore en développement, visant une mise en œuvre complète d'ici 2030. Par conséquent, une assurance maladie privée volontaire, en particulier une assurance maladie internationale, est fortement recommandée. Ces plans devraient inclure une couverture robuste pour l'évacuation médicale, car les affections graves nécessitent souvent un transfert vers des établissements à Mayotte, la Réunion ou l'Afrique du Sud. Les plans fournis par l'employeur peuvent offrir une certaine couverture, mais les expatriés doivent vérifier l'étendue de la couverture locale et internationale, en particulier pour les évacuations d'urgence. Les primes mensuelles typiques pour une assurance maladie d'expatrié sont estimées entre 90 et 180 USD. Il est crucial de confirmer avec votre assureur l'étendue de leur couverture aux Comores et les procédures de réclamation, car le paiement anticipé est la norme.

Les soins de santé aux Comores nécessitent généralement des paiements directs. Une consultation chez un médecin généraliste (MG) dans un établissement public pourrait être gratuite pour les Comoriens, mais pour les étrangers, une visite privée chez un MG coûte généralement entre 5 et 15 USD ou 10 €. Les consultations de spécialistes sont limitées et leurs coûts varient, mais les soins spécialisés sont largement indisponibles pour les affections complexes. Les séjours hospitaliers et les procédures peuvent être coûteux, avec des exemples comme une appendicectomie coûtant au moins 200 € (environ 215 USD) et une césarienne jusqu'à 600 € (environ 645 USD). Les patients sont souvent tenus d'acheter leurs propres médicaments, liquides intraveineux et même des fournitures de base dans les pharmacies privées avant le traitement dans les hôpitaux publics. Les médicaments sur ordonnance sont souvent en pénurie, et les pharmacies sont limitées, surtout en dehors de Moroni. Les soins dentaires et optiques sont également basiques et nécessiteraient un paiement direct. Les évacuations médicales pour les cas graves représentent une dépense importante, estimée entre 6 000 et 15 000 USD, soulignant la nécessité d'une assurance complète.

Les services médicaux d'urgence aux Comores sont limités. Le numéro d'urgence principal pour l'assistance médicale est le 112. Les autres numéros d'urgence incluent le 17 pour la Police et le 18 pour les Pompiers/Gendarmerie. Cependant, les services d'ambulance ne sont pas toujours fiables ou facilement disponibles, et il est souvent recommandé d'appeler directement l'hôpital le plus proche ou d'organiser un transport privé. Les hôpitaux clés comme l'Hôpital National El-Maarouf à Moroni (+269 773 26 04) peuvent être contactés directement pour les urgences. En cas d'urgence médicale grave, le traitement n'est pas gratuit pour les étrangers, et un paiement anticipé est attendu. Pour les affections critiques, en particulier celles nécessitant des soins avancés, une évacuation médicale par ambulance aérienne vers des centres régionaux comme Mayotte, la Réunion ou l'Afrique du Sud est fréquemment nécessaire. Plusieurs services d'ambulance aérienne privés opèrent vers et depuis les Comores, offrant un transport de soins intensifs.

La qualité des soins de santé aux Comores est généralement considérée comme basique et inférieure aux normes internationales. Bien que certaines sources de 2025 suggèrent des améliorations et un intérêt croissant pour le tourisme médical, le consensus parmi les avis aux expatriés et aux voyageurs reste prudent. L'Initiative de Mesure des Droits Humains constate que les Comores remplissent 64,2 % de ce qu'elles devraient pour le droit à la santé en fonction de leur niveau de revenu, la santé reproductive étant particulièrement faible à 21,6 %. Les points forts, comme soulignés par certains rapports récents, incluent les efforts en matière de santé maternelle et infantile à travers des programmes comme le PASCO, qui a conduit à la réhabilitation d'installations et à la formation de professionnels. Cependant, les faiblesses sont profondes, notamment un grave manque de ressources, d'équipements modernes, de personnel spécialisé, et d'approvisionnements constants en électricité et en eau dans de nombreux établissements. Les capacités spécialisées sont très limitées ou inexistantes, entraînant de longs temps d'attente pour les soins complexes et une forte dépendance aux évacuations médicales. Comparé aux territoires français d'outre-mer voisins comme Mayotte et la Réunion, le système de santé des Comores est nettement moins développé, faisant de ces îles des destinations courantes pour les transferts médicaux.